Çekerek Nehri  Havzası Rehabilitasyon Projesinin Kapsadığı İller;
 
Yozgat ili; 8 ilçe ile (Merkez, Sorgun, Aydıncık, Çekerek, Kadışehri, Akdağmadeni, Saraykent, Çayıralan) proje alanının % 60.5’ini,
Çorum ili; 2 İlçe (Alaca ve Ortaköy)  proje alanının %18,8’ini,
Tokat ili; 3 ilçe ile (Artova, Sulusaray ve Yeşilyurt)proje alanının %13’ünü,
Sivas ili;  1 ilçe ile (Yıldızeli) proje alanının %9.6’sini temsil etmektedir.